Mestrados e Doutorados Concluídos

Ano Nível Título Aluno Orientador Defesa
2020Mestrado Detecção de populações em dados de sequenciamento de RNA de células individuais por meio de módulos de coexpressão Tiago Lubiana Alves Helder Takashi Imoto Nakaya 31/03/2020
2020Mestrado Identificação e anotação de RNAs longos não-codificantes em Schistosoma mansoni e Schistosoma japonicum  Lucas Ferreira Maciel Sergio Verjovski de Almeida 23/03/2020
2019Doutorado Regulação pós-transcricional em Halobacterium salinarum NRC-1: caracterização do gene VNG_RS05855 Junier Marrero Gutierrez Tie Koide 30/10/2019
2019Doutorado GTACG: Um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de um mesmo ramo evolutivo Caio Rafael do Nascimento Santiago Luciano Antonio Digiampietri 25/10/2019
2019Mestrado Genômica comparativa aplicada no estudo da invasividade de Streptococcus pyogenes Suzane de Andrade Barboza Luciano Antonio Digiampietri 21/10/2019
2019Mestrado Genômica comparativa e filogenômica de Xylella fastidiosa Guillermo Uceda Campos Aline Maria da Silva 27/09/2019
2019Mestrado Análise comparativa do genoma de bacteriófagos isolados da compostagem e estudo dos determinantes de sua interação com Pseudomonas aeruginosa Fernando Pacheco Nobre Rossi Aline Maria da Silva 04/09/2019
2019Mestrado Análise  Estrutural de Sítios de Fosforilação em Proteína Juan Enrique Faya Castillo Paulo Sérgio Lopes de Oliveira 22/08/2019
2019Doutorado Classificação Taxonômica de Sequências obtidas com Meta-ômicas por meio de Integração de Dados Felipe Prata Lima João Carlos Setubal 20/08/2019
2019Mestrado Herdabilidade e Estudo de Associação Genômica Ampla (GWAS) de Atividade Física Autorreportada - uma investigação de famílias brasileiras Jean Michel Rocha Sampaio Leite Julia Maria Pavan Soler 09/08/2019
2019Mestrado Análise transcritômica de amostras humanas naturalmente infectadas por Chikungunya Virus Natália Baptista Cruz Helder Takashi Imoto Nakaya 05/08/2019
2019Doutorado Uma abordagem integrada para a construção e utilização de HMMs de perfil para análises genômicas e metagenômicas Liliane Santana Oliveira Kashiwabara Arthur Gruber 02/08/2019
2019Mestrado Análise transcritômica de macacos Rhesus durante infecção por Zika Vírus Mariana Araújo Pereira Helder Takashi Imoto Nakaya 12/07/2019
2019Doutorado Direto Rastreando arbovírus em ambientes silvestre e urbano Marielton dos Passos Cunha Paolo Marinho de Andrade Zanotto 10/07/2019
2019Doutorado Mineração de dados de anemia falciforme e priapismo Mina Cintho Ozahata João Eduardo Ferreira 02/07/2019
2019Mestrado Papel do colágeno na síndrome congênita de Zika: uma abordagem de Biologia de Sistemas Fábio Baldívia Pohl Helder Takashi Imoto Nakaya 04/06/2019
2019Doutorado Direto Desenvolvimento de uma Ferramenta Computacional para Análise de Co-Expressão Gênica e sua Aplicação na Biologia de Sistemas Pedro de Sá Tavares Russo Helder Takashi Imoto Nakaya 09/05/2019
2019Mestrado Análise da Tetramerização da Proteína CD38 por meio de Docking Molecular Jadson Carlos dos Santos Silvana Giuliatti 08/05/2019
2019Doutorado Direto Ordenação evolutiva de genes Pedro Ivo Gomes de Faria João Carlos Setubal 27/03/2019
2019Doutorado Direto Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático Omar Julio Sosa Eduardo Moraes Rego Reis 27/02/2019
2019Mestrado Construção e Aplicação de HMMs de Perfil para a Detecção e Classificação de Vírus Miriã Nunes Guimarães Arthur Gruber 22/02/2019
2019Doutorado Direto Predição de função para TSSaRNAs (transcritos associados a sitios de início de transcrição) em Halobacterium salinarum NRC-1 Yagoub Ali Ibrahim Adam Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio 07/02/2019
2018Mestrado Usando Biologia de Sistemas para entender a Imunossenescência Fernando Marcon Passos Helder Takashi Imoto Nakaya 13/12/2018
2018Doutorado Investigação de perfis microbianos humanos e sua relação com o câncer Andrew Maltez Thomas João Carlos Setubal 12/12/2018
2018Doutorado Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs Paula Prieto Oliveira Ariane Machado Lima 10/12/2018
2018Doutorado Transcriptoma, Sítios de Ligação para Fatores de Transcrição e Região Promotora de cana-de-açúcar Mauro de Medeiros Oliveira Glaucia Mendes Souza 26/09/2018
2018Mestrado Halobacterium salinarum NRC-1: Rede de Regulação Gênica e sua análise probabilística Guilherme Martins Crocetti Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio 08/05/2018
2018Mestrado Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus Anderson Carvalho Morais João Marcelo Pereira Alves 03/05/2018
2018Doutorado Genômica Comparada e a Evolução da Defesa Química em Anfíbios Denis Jacob Machado Taran Grant 10/04/2018
2018Mestrado Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes Clebiano da Costa Sá Ariane Machado Lima 23/03/2018
2018Doutorado Redes Neurais Residuais Profundas e Autômatos Celulares como Modelos para Predição que Fornecem Informação Sobre a Formação de Estruturas Secundárias Proteicas. José Geraldo de Carvalho Pereira Paulo Sérgio Lopes de Oliveira 15/03/2018
2018Mestrado BioNetStat: Uma ferramenta para análise diferencial de redes biológicas Vinícius Jardim Carvalho Marcos Silveira Buckeridge 08/02/2018
2018Mestrado Detecção de Copy Number Variation (CNV) e sua caracterização na população brasileira  Ana Cláudia Martins Ciconelle Julia Maria Pavan Soler 06/02/2018
2017Doutorado Systems Integration Tool: uma ferramenta para integração e visualização de dados em larga escala e sua aplicação em cana-de-açúcar Amanda Rusiska Piovezani Marcos Silveira Buckeridge 14/12/2017
2017Mestrado Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue Matheus Carvalho Bürger Helder Takashi Imoto Nakaya 27/11/2017
2017Mestrado Análise do transcritoma de Haemophilus influenzae tipo b durante o processo de fermentação em biorreator Carlos Eduardo Madureira Trufen Anatoli Iambartsev 24/11/2017
2017Mestrado Determinação pré-natal não invasiva de paternidade utilizando micro-haplótipos Jaqueline Yu Ting Wang Helder Takashi Imoto Nakaya 24/11/2017
2017Doutorado Arquitetura genética dos genes codificadores de proteínas ligantes de RNA Fernando Cipriano de Andrade Oliveira André Fujita 22/11/2017
2017Mestrado Análise do transcritoma do mexilhão marrom (Perna perna) sob contaminação por antraceno Jhonatas Sirino Monteiro João Carlos Setubal 30/10/2017
2017Mestrado Predição Computacional de Sítios de Ligação de Fatores de Transcrição Baseada em Gramáticas Regulares Estocásticas. Antonio Ferrão Neto Ariane Machado Lima 27/10/2017
2017Mestrado Modelagem e implementação de banco de dados clínicos e moleculares de pacientes com câncer e seu uso para identificação de marcadores em câncer de pâncreas Ester Risério Matos Bertoldi Eduardo Moraes Rego Reis 20/10/2017
2017Doutorado Estruturas de Redes em Ossos ao longo do desenvolvimento Cynthia Martins Villar Couto Luciano da Fontoura Costa 09/10/2017
2017Doutorado O papel de Transferência Horizontal de Genes na história evolutiva de duas classes de genes em bactérias Luiz Thibério Lira Diniz Rangel João Carlos Setubal 10/08/2017
2017Mestrado "Uso de técnicas de reconhecimento de padrões e genetica para a predição de transtornos psiquiatricos da infância" Walkiria Karla Resende Helena Paula Brentani 09/08/2017
2017Doutorado Identificação e análise in silico de ncRNAs empregando dados de RNA-seq em Leishmania. Patrícia de Cássia Ruy Angela Kaysel Cruz 08/08/2017
2017Mestrado Alinhamento Múltiplo de Genomas de Eucariotos com Montagens Altamente Fragmentadas George Willian Condomitti Epamino João Carlos Setubal 04/08/2017
2017Mestrado Caravela: um navegador para metagenomas Gianluca Major Machado da Silva João Carlos Setubal 12/06/2017
2017Doutorado O transcritoma da retinopatia induzida por oxigênio e uma assinatura gênica prognóstica baseada em angiogênese para predição de recidiva de cancer de mama Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de Sousa João Carlos Setubal 02/06/2017
2017Doutorado Direto Um modelo Bayesiano de Meta-Análise para dados de Chip-Seq Pablo de Morais Andrade Carlos Alberto de Braganca Pereira 17/04/2017
2017Doutorado LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local Lucas Ferreira da Silva Sergio Verjovski de Almeida 11/04/2017
2017Mestrado COARSE-GRAINED MODELING OF THE PROTEIN COMPLEXATION PHENOMENA Sergio Alejandro Poveda Cuevas Fernando Luis Barroso da Silva 10/04/2017
2017Mestrado Análise de transcritomas de células de pacientes xeroderma pigmentosum após irradiação com luz UVA e estudo de retrocópias de genes de reparo Francisco Ivanio Arruda Alves Carlos Frederico Martins Menck 21/02/2017
2017Doutorado Direto A transcrição pervasiva na archaea Halobacterium salinarum NRC-1 e a identificação de novos transcritos Felipe ten Caten Tie Koide 15/02/2017
2017Mestrado Estudo por simulação computacional em larga escala da complexação de proteínas do leite   Lariani Aparecida Delboni Fernando Luis Barroso da Silva 24/01/2017
2016Mestrado Análise exploratória de genes compostos predominantemente por microexons arranjados em tandem em uma coleção de anotações de genomas  Bruno Ferreira de Souza Sergio Verjovski de Almeida 21/12/2016
2016Doutorado Análise computacional dos genomas de duas estirpes brasileiras de Bradyrhizobium de importância econômica Gesiele Almeida Barros de Carvalho Marie Anne van Sluys 09/12/2016
2016Mestrado Análise computacional da diversidade viral presente na comunidade microbiana do processo de compostagem do Zoológico de São Paulo Deyvid Emanuel Amgarten João Carlos Setubal 18/11/2016
2016Mestrado Análise do Metaboloma da Cana-de-Açúcar ao Longo do Ciclo de Maturação da Planta Davi Toshio Inada Glaucia Mendes Souza 17/11/2016
2016Mestrado Estudo comparativo de duas estratégias utilizadas na busca de relações funcionais entre genes Juan Manuel Vidal Garcia André Fujita 13/10/2016
2016Doutorado Origem de genes recentes, uma abordagem com PSSMs deterioradas e arquiteturas de domínio proteico Diego Trindade de Souza Sergio Russo Matioli 06/10/2016
2016Doutorado Direto Suporte ao desenvolvimento e à composição de serviços web semânticos para a análise de expressão gênica Gabriela Der Agopian Guardia Clever Ricardo Guareis de Farias 12/08/2016
2016Mestrado Uma Arquitetura de Question-Answering Instanciada no Domínio  de Doenças Crônicas Luciana Farina Almansa Alessandra Alaniz Macedo 08/08/2016
2016Mestrado Análise global da expressão de RNAs não codificadores no sistema imunológico humano na senescência e sepse Diogo Vieira da Silva Pellegrina Eduardo Moraes Rego Reis 28/07/2016
2016Doutorado Bioinformática aplicada à biologia sistêmica para a identificação dos fatores regulatórios do acúmulo de sacarose no colmo da cana-de-açúcar Fabrício Edgar de Moraes Carlos Alberto Labate 15/07/2016
2016Mestrado Desenvolvimento de um pipeline para anáise genômica de metilação do DNA Henrique Cursino Vieira Helena Paula Brentani 25/05/2016
2016Doutorado Integração de dados na inferência de redes de genes: avaliação de informações biológicas e características topológicas Fábio Fernandes da Rocha Vicente Fabricio Martins Lopes 02/05/2016
2016Doutorado Identificação in silico de ncRNAs no organismo modelo Halobacterium salinarum NRC-1 Marcos Abraão de Souza Fonseca Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio 25/04/2016
2016Mestrado Caracterização de sítios conformacionais de fosforilação em proteínas Felipe Augusto Nunes Ferraz Paulo Sérgio Lopes de Oliveira 25/04/2016
2016Doutorado Caracterização e modelagem da atividade eletrofisiológica em pacientes com epilepsia Abner Cardoso Rodrigues Neto Koichi Sameshima 20/04/2016
2016Mestrado Reconstrução da rede metabólica em escala genômica da bactéria Burkholderia sacchari Paulo Moisés Raduan Alexandrino André Fujita 15/04/2016
2016Doutorado Direto Desenvolvimento de um modelo biofísico para a descrição do processo de reparo de quebra-dupla em DNA Aymara Martínez Aragón Joao Dias de Toledo Arruda Neto 29/03/2016
2016Mestrado Processamento, extração de características e análise morfométrica automatizada de fibras mielínicas Rômulo Bourget Novas Joaquim Cezar Felipe 18/03/2016
2015Mestrado Ferramenta computacional para análise integrada de dados clínicos e biomoleculares Yuri Ferretti Joaquim Cezar Felipe 11/12/2015
2015Mestrado Implementação de abordagens computacionais para identificação de RNAs longos não codificadores envolvidos na diferenciação neural Gabriel Francisco Zaniboni Eduardo Moraes Rego Reis 03/12/2015
2015Doutorado Algoritmos evolutivos aplicados na investigação da adaptabilidade do código genético Lariza Laura de Oliveira Renato Tinós 30/11/2015
2015Doutorado Direto Implementação de uma abordagem híbrida utilizando modelagem comparativa e ab initio para predição de estruturas tridimensionais de proteínas contendo múltiplos domínios com conectores flexíveis  Rodrigo Vargas Honorato Paulo Sérgio Lopes de Oliveira 17/11/2015
2015Doutorado Análise de componentes esparsos locais com aplicações em ressonância magnética funcional Gilson Vieira Luíz Antonio Baccala 13/10/2015
2015Mestrado Busca de variantes em sequência de DNA proveniente de pacientes com deficiência em processos de reparo do genoma Livia Maria Silva Moura Carlos Frederico Martins Menck 08/10/2015
2015Mestrado Caracterização da estrutura e dinâmica das redes funcionais neurais durante um processo de indução anestésica Eduardo Cocca Padovani André Fujita 06/10/2015
2015Mestrado Reconstrução e análise de genomas de bactérias de compostagem a partir de dados metagenômicos Leandro Nascimento Lemos João Carlos Setubal 23/09/2015
2015Mestrado Suporte ao desenvolvimento e à integração de ontologias no domínio biomédico Ricardo Cacheta Waldemarin Clever Ricardo Guareis de Farias 21/09/2015
2015Mestrado Exploração de espaços de parâmetros de modelos biológicos sob diferentes paradigmas estatisticos Andre Chalom Machado de Oliveira Paulo Inácio de Knegt López de Prado 02/09/2015
2015Doutorado Análise computacional da variação do potencial metabólico microbiano em metagenomas Deibs Barbosa João Carlos Setubal 21/08/2015
2015Mestrado Modelagem computacional de famílias de proteínas microbianas relevantes para produção de bioenergia Fernanda Orpinelli Ramos do Rego João Carlos Setubal 17/08/2015
2015Doutorado Uma abordagem integrativa usando dados de interação proteína-proteína e estudos genéticos para priorizar genes e funções biológicas em transtorno de déficit de atenção e hiperatividade Leandro de Araujo Lima Helena Paula Brentani 22/07/2015
2015Doutorado Direto Uma abordagem de integração de dados de redes PPI e expressão gência para priorizar genes relacionados a doenças complexas Sérgio Nery Simões Ronaldo Fumio Hashimoto 30/06/2015
2015Doutorado Direto Desenvolvimento da plataforma CaneRegNet para anotação funcional e análises do transcriptoma da cana-de-açúcar Milton Yutaka Nishiyama Junior Glaucia Mendes Souza 13/04/2015
2015Mestrado Utilização de informações termodinâmicas e estruturais na predição de sítios de ligação de receptores nucleares ao DNA: uma abordagem computacional Ana Claudia Mancusi Valeije Paulo Sérgio Lopes de Oliveira 04/02/2015
2014Doutorado Direto Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais Caio César de Melo Freire Paolo Marinho de Andrade Zanotto 05/12/2014
2014Mestrado Análise gênica de comorbidades a partir da integração de dados epidemiológicos Karla Ferraz Néto Evandro Eduardo Seron Ruiz 01/12/2014
2014Mestrado Infraestrutura computacional para avaliação de similaridade funcional composta entre microRNAs baseada em ontologias Mariana Yuri Sasazaki Joaquim Cezar Felipe 19/08/2014
2014Mestrado Framework para classificação das mutações de vírus HIV Mina Cintho Ozahata João Eduardo Ferreira 15/05/2014
2014Doutorado Direto Metodologia para integração de dados genômicos, transcriptômicos e epigenéticos de câncer de pênis Fabio Albuquerque Marchi Silvia Regina Rogatto 14/04/2014
2013Doutorado Explorando a complexidade do transcriptoma humano José Eduardo Kroll Sandro José de Souza 12/12/2013
2013Doutorado Direto Troost - Busca de interações entre trios de SNPs em estudos de associação de genoma inteiro José Osório de Oliveira Azevedo Neto Sergio Russo Matioli 07/11/2013
2013Mestrado Sifter-T: Um framework escalável para anotação filogenômica probabilística funcional de domínios protéicos Danillo Cunha de Almeida e Silva Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio 25/10/2013
2013Mestrado Busca guiada de patentes de Bioinformática Marcio Branquinho Dutra Alessandra Alaniz Macedo 17/10/2013
2013Mestrado Um filtro iterativo utilizando árvores de decisão Oscar Picchi Netto José Augusto Baranauskas 24/09/2013
2013Mestrado SIMTar: uma ferramenta para predição de SNPs interferindo em sítios alvos de microRNAs Amanda Rusiska Piovezani Ariane Machado Lima 12/09/2013
2013Mestrado Uma adaptação do método Binary Relevance utilizando árvores de decisão para problemas de classificação multirrótulo aplicado à genômica funcional Erica Akemi Tanaka José Augusto Baranauskas 30/08/2013
2013Mestrado Uma abordagem para a construção de uma única árvore a partir de uma Random Forest para classificação de bases de expressão gênica Thais Mayumi Oshiro José Augusto Baranauskas 27/08/2013
2013Doutorado Direto Caracterização in silico e análise de expressão de RNAs não codificadores longos no genoma de eucariotos Vinicius Ramos Henriques Maracajá Coutinho Sergio Verjovski de Almeida 13/08/2013
2013Mestrado Análise in silico de regiões promotoras de genes de Xylella fastidiosa Fernando Domingues Kümmel Tria Aline Maria da Silva 24/06/2013
2013Mestrado Método de apoio à pesquisa e ao diagnóstico clínico na identificação de acometimento em diferentes tipos de fibras musculares por meio de imagens histopatológicas Marlon Polo de Melo Joaquim Cezar Felipe 17/06/2013
2013Mestrado Genômica translacional: integrando dados clínicos e biomoleculares Newton Shydeo Brandão Miyoshi Joaquim Cezar Felipe 06/02/2013
2012Doutorado Direto Estudo da poliadenilação alternativa: efeito dos polimorfismos nos elementos em cis no RNA e de transcritos em antissenso Suzana Andreoli Marques Ezquina Sandro José de Souza 25/10/2012
2012Mestrado Dinâmica da fermentação alcóolica: aplicação de redes booleanas na dinâmica de expressão gênica em linhagens de Saccharomyces Cerevisiae durante o processo fermentativo Melline Fontes Noronha Ronaldo Fumio Hashimoto 17/10/2012
2012Mestrado Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes Vitor Ferreira Onuchic Alan Mitchell Durham 05/10/2012
2012Mestrado Função de avaliação dinâmica em algoritmos genéticos aplicados na predição de estruturas tridimensionais de proteínas Luís Henrique Uchida Ishivatari Renato Tinós 28/09/2012
2012Mestrado Auto-organização da população em sistemas imunológicos artificiais aplicada ao docking de proteínas Helder Ken Shimo Renato Tinós 17/07/2012
2012Mestrado Método para auxiliar a interpretação de clusters de expressão gênica considerando sumarização automática Daniane Silva de Paula Alessandra Alaniz Macedo 29/05/2012
2012Doutorado Descrição da proveniência de dados para extração de conhecimento em sistemas de informação de hemoterapia Fernanda Nascimento Almeida Ester Cerdeira Sabino 23/05/2012
2012Mestrado Uma abordagem para a indução de árvores de decisão voltada para dados de expressão gênica Pedro Santoro Perez José Augusto Baranauskas 18/04/2012
2012Doutorado Bioinformática aplicada em RNomics: estratégias computacionais para caracterização de RNAs não-codificadores Alexandre Rossi Paschoal Alan Mitchell Durham 13/04/2012
2012Mestrado Uso de mapeamento conceitual para redução da descontinuidade semântica na recuperação de imagens microscópicas de carcinoma tireoidiano Hugo César Pessotti Alessandra Alaniz Macedo 13/04/2012
2012Mestrado Análise computacional do genoma e transcritoma de Plasmodium vivax: contribuições da bioinformática para o estudo da malária Bruna Renata Silva Corrêa Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio 02/04/2012
2012Mestrado Representação paramétrica de famílias de redes booleanas que produzem ondas de propagação Ubiratan Augusto Lima Junior Barrera 06/03/2012
2011Mestrado Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica Flavia Akemi Miyazaki Clever Ricardo Guareis de Farias 15/12/2011
2011Mestrado Auxílio na prevenção de doenças crônicas por meio de mapeamento e relacionamento conceitual de informações em biomedicina Juliana Tarossi Pollettini Alessandra Alaniz Macedo 28/11/2011
2011Mestrado Método para processamento e análise computacional de imagens histopatológicas visando apoiar o diagnóstico de câncer de colo de útero Gisele Helena Barboni Miranda Joaquim Cezar Felipe 24/11/2011
2011Mestrado Modelagem matemática-computacional da conectividade cerebral em ressonância magnética funcional para o estudo do estado de repouso Gilson Vieira Luíz Antonio Baccala 08/07/2011
2011Mestrado Desenvolvimento de um algoritmo para identificação e caracterização de cavidades em regiões específicas de estruturas tridimensionais de proteínas Saulo Henrique Pires de Oliveira Paulo Sérgio Lopes de Oliveira 25/05/2011
2011Mestrado Uso de estratégias baseadas em conhecimento para algoritmos genéticos aplicados à predição de estruturas tridimensionais de proteínas Lariza Laura de Oliveira Renato Tinós 20/05/2011
2011Mestrado Canalização: fenótipos robustos como consequência de características da rede de regulação gênica Vitor Hugo Louzada Patricio Ronaldo Fumio Hashimoto 20/04/2011
2011Doutorado Redes complexas de expressão gênica: síntese, identificação, análise e aplicações Fabricio Martins Lopes Roberto Marcondes Cesar Junior 21/02/2011
2010Doutorado Direto Seleção natural no vírus da hepatite C: influência do sistema imune na resposta ao tratamento Artur Trancoso Lopo de Queiroz Sergio Russo Matioli 03/11/2010
2010Mestrado Medidas de dependência entre séries temporais: estudo comparativo, análise estatística e aplicações em neurociências Carlos Stein Naves de Brito Koichi Sameshima 29/07/2010
2010Doutorado Direto Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação da expressão gênica Marcio Augusto Afonso de Almeida Paulo Sérgio Lopes de Oliveira 16/04/2010
2010Doutorado Direto Identificação de transferência gênica horizontal em procariotos, estudo do regulon SOS de Caulobacter crescentus e análise estatística de colocalização de posições genômicas Apuã César de Miranda Paquola Carlos Frederico Martins Menck 11/02/2010
2009Doutorado Direto Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas Mauricio Egidio Cantão Eliana Gertrudes Macedo Lemos 01/12/2009
2009Doutorado Direto Planejamento, gerenciamento e análise de dados de microarranjos de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico de cânceres humanos Ana Carolina Quirino Simões Aline Maria da Silva 12/05/2009
2009Doutorado Direto Técnicas para análise do crescimento e movimento das células neurais Leandro Carrijo Cintra Luciano da Fontoura Costa 06/05/2009
2009Doutorado Direto Medidas de fluxo de informação com aplicação em neurociência Daniel Yasumasa Takahashi Koichi Sameshima 15/01/2009
2008Doutorado Direto Análise da via de regulação gênica por ácido retinóico: uma abordagem por bioinformática e biologia estrutural Tiago José Paschoal Sobreira Paulo Sérgio Lopes de Oliveira 11/12/2008
2008Doutorado Direto Identificação in-silico de genes humanos submetidos à expressão alélica diferencial Jorge Estefano Santana de Souza Sandro José de Souza 02/12/2008
2008Doutorado Direto Morfometria computacional de frangos de corte submetidos a duas dietas distintas: suplementação mineral quelada versus suplementação mineral tradicional Rafael Carvalho de Oliveira Marcelo Emílio Beletti 25/09/2008
2008Doutorado Direto Métodos estatísticos para a análise de bibliotecas digitais de expressão gênica Leonardo Varuzza Carlos Alberto de Braganca Pereira 03/09/2008
2008Doutorado Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV Luciano Vieira de Araújo João Eduardo Ferreira 13/05/2008
2008Doutorado Modelos discretos para sistemas de sinalização celular baseados no contato célula-célula Luiz Carlos da Silva Rozante Marco Dimas Gubitoso 25/04/2008
2008Doutorado Representação de sistemas biológicos a partir de sistemas dinâmicos: controle da transcrição a partir do estrógeno Marcelo Ris Junior Barrera 14/04/2008
2008Doutorado Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni. Thiago Motta Venancio Sergio Verjovski de Almeida 14/02/2008
2007Doutorado Direto Métodos computacionais para a caracterização e análise da relação entre anatomia e expressão gênica em sistemas biológicos. Bruno Augusto Nassif Travençolo Luciano da Fontoura Costa 20/12/2007
2007Doutorado Bioinformática estrutural de proteínas modificadas por eventos de splicing alternativo Elza Helena Andrade Barbosa Durham Sandro José de Souza 10/12/2007
2007Doutorado "Seleção de modelos através de um teste de hipótese genuinamente Bayesiano: misturas de normais multivariadas e hipóteses separadas" Marcelo de Souza Lauretto Julio Michael Stern 03/10/2007
2007Doutorado Direto "Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias" André Fujita Carlos Eduardo Ferreira 10/08/2007
2007Doutorado Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas Nestor Walter Trepode Junior Barrera 27/06/2007
2007Doutorado "Fatores moleculares da determinação do sexo e casta e evolução de famílias multigênicas na abelha eusocial Apis mellifera" Alexandre dos Santos Cristino Zila Luz Paulino Simoes 30/05/2007
2007Doutorado Implicações funcionais de eventos de splicing alternativo no proteoma humano Fabio Passetti Paulo Sérgio Lopes de Oliveira 16/05/2007
2007Doutorado Métodos estatísticos para a análise de dados de cDNA microarray em um ambiente computacional integrado Gustavo Henrique Esteves Eduardo Jordao Neves 23/03/2007
2007Doutorado Direto Cadeias estocásticas parcimoniosas com aplicações à classificação e filogenia das seqüências de proteínas Florencia Graciela Leonardi Jefferson Antonio Galves 19/01/2007
2007Doutorado Análise e reconhecimento digital de formas biológicas para o diagnóstico automático de parasitas do gênero Eimeria Cesar Armando Beltran Castañon Arthur Gruber 16/01/2007
2006Doutorado Predição de RNAs não codificantes e sua aplicação na busca do componente RNA da telomerase Ariane Machado Lima Alan Mitchell Durham 20/12/2006
2006Doutorado Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação Fábio Nakano Carlos Alberto de Braganca Pereira 09/11/2006
2006Doutorado Análise estatística na interpretação de imagens: microarranjos de DNA e ressonância magnética funcional Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio Carlos Alberto de Braganca Pereira 01/09/2006